Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP17L12C9JPN9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms