Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms