Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms