Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms