Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms