Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC169A6NNP5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms