Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms