Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS37CA5D8V6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS37CA5D8V6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS37CA5D8V6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS37CA5D8V6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS37CA5D8V6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS37CA5D8V6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS37CA5D8V6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS37CA5D8V6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS37CA5D8V6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS37CA5D8V6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS37CA5D8V6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS37CA5D8V6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms