Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX11Q9Y5W9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX11Q9Y5W9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX11Q9Y5W9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms