Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C1

NOP16, Nucleolar protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP16Q9Y3C1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP16Q9Y3C1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP16Q9Y3C1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP16Q9Y3C1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOP16Q9Y3C1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOP16Q9Y3C1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms