Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSX2IPQ9Y2D8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSX2IPQ9Y2D8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSX2IPQ9Y2D8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms