Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BTRCQ9Y297 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BTRCQ9Y297 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BTRCQ9Y297 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms