Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM9Q9P0T7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM9Q9P0T7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM9Q9P0T7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM9Q9P0T7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms