Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX18Q9NVP1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX18Q9NVP1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX18Q9NVP1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX18Q9NVP1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms