Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SALL1Q9NSC2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SALL1Q9NSC2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SALL1Q9NSC2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL1Q9NSC2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms