Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX5

NPDC1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPDC1Q9NQX5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NPDC1Q9NQX5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPDC1Q9NQX5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPDC1Q9NQX5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms