Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECTIN3Q9NQS3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NECTIN3Q9NQS3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms