Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A3Q9NQ40 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC52A3Q9NQ40 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC52A3Q9NQ40 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC52A3Q9NQ40 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms