Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE7BQ9NP56 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE7BQ9NP56 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE7BQ9NP56 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE7BQ9NP56 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE7BQ9NP56 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE7BQ9NP56 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE7BQ9NP56 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
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