Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS7BQ9H9Q2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS7BQ9H9Q2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPS7BQ9H9Q2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPS7BQ9H9Q2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS7BQ9H9Q2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS7BQ9H9Q2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms