Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
BBS2Q9BXC9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BBS2Q9BXC9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBS2Q9BXC9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms