Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRA6Q9BX79 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRA6Q9BX79 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
STRA6Q9BX79 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRA6Q9BX79 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRA6Q9BX79 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms