Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNPPD1Q9BV87 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CNPPD1Q9BV87 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNPPD1Q9BV87 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms