Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF1Q9BSM1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF1Q9BSM1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF1Q9BSM1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF1Q9BSM1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF1Q9BSM1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF1Q9BSM1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF1Q9BSM1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCGF1Q9BSM1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCGF1Q9BSM1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCGF1Q9BSM1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCGF1Q9BSM1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCGF1Q9BSM1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF1Q9BSM1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms