Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM56Q9BRZ2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM56Q9BRZ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM56Q9BRZ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM56Q9BRZ2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM56Q9BRZ2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM56Q9BRZ2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM56Q9BRZ2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM56Q9BRZ2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM56Q9BRZ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM56Q9BRZ2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM56Q9BRZ2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM56Q9BRZ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM56Q9BRZ2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM56Q9BRZ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM56Q9BRZ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM56Q9BRZ2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms