Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZSWIM1Q9BR11 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZSWIM1Q9BR11 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZSWIM1Q9BR11 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms