Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX18Q96RF0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX18Q96RF0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX18Q96RF0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms