Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A2Q96QD8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC38A2Q96QD8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC38A2Q96QD8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A2Q96QD8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms