Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDXPQ96GD0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDXPQ96GD0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDXPQ96GD0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDXPQ96GD0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDXPQ96GD0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms