Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNFT2Q96EX2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT2Q96EX2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNFT2Q96EX2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNFT2Q96EX2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms