Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2A3Q93084 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A3Q93084 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms