Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC12Q8WVT3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TRAPPC12Q8WVT3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC12Q8WVT3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC12Q8WVT3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC12Q8WVT3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms