Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRN4Q8WUT4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN4Q8WUT4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRN4Q8WUT4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRN4Q8WUT4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
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