Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PATJQ8NI35 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PATJQ8NI35 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PATJQ8NI35 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PATJQ8NI35 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms