Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLGN4YQ8NFZ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms