Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK2A3Q8NEV1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK2A3Q8NEV1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK2A3Q8NEV1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK2A3Q8NEV1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms