Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC17Q8N6Y2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC17Q8N6Y2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC17Q8N6Y2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC17Q8N6Y2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.2 ms