Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U1

Putative uncharacterized protein LOC400692, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N3U1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N3U1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N3U1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N3U1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N3U1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N3U1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N3U1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N3U1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N3U1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N3U1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N3U1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N3U1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N3U1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N3U1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N3U1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N3U1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N3U1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N3U1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N3U1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N3U1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8N3U1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8N3U1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8N3U1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8N3U1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8N3U1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8N3U1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8N3U1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8N3U1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8N3U1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8N3U1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8N3U1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8N3U1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8N3U1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8N3U1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8N3U1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8N3U1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8N3U1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8N3U1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8N3U1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8N3U1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8N3U1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8N3U1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8N3U1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8N3U1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8N3U1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8N3U1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8N3U1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8N3U1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8N3U1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8N3U1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8N3U1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8N3U1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8N3U1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8N3U1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8N3U1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8N3U1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8N3U1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8N3U1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8N3U1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8N3U1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8N3U1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8N3U1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8N3U1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q8N3U1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8N3U1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8N3U1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8N3U1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8N3U1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8N3U1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8N3U1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8N3U1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8N3U1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8N3U1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8N3U1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8N3U1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8N3U1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8N3U1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8N3U1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8N3U1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8N3U1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8N3U1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8N3U1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8N3U1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8N3U1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8N3U1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8N3U1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8N3U1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8N3U1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8N3U1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8N3U1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8N3U1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8N3U1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8N3U1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8N3U1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8N3U1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8N3U1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8N3U1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8N3U1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8N3U1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8N3U1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms