Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGI4Q8N135 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LGI4Q8N135 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGI4Q8N135 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms