Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF39Q86UA1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF39Q86UA1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF39Q86UA1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF39Q86UA1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms