Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPGS1Q6ZTW0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TPGS1Q6ZTW0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPGS1Q6ZTW0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms