Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATRAIDQ6UW56 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATRAIDQ6UW56 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATRAIDQ6UW56 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATRAIDQ6UW56 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms