Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TXNDC11Q6PKC3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNDC11Q6PKC3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNDC11Q6PKC3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms