Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC174Q6PII3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC174Q6PII3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC174Q6PII3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC174Q6PII3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms