Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL35Q6PF15 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL35Q6PF15 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL35Q6PF15 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL35Q6PF15 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms