Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEK5Q6P3R8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK5Q6P3R8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK5Q6P3R8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms