Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.996e-7■■■■■ 63.4
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PRPF8Q6P2Q9 MLEC-205ENST00000545525 549 ntTSL 26.24□□□□□ -1.417e-9■■■■■ 62.1
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PRPF8Q6P2Q9 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.593e-9■■■■■ 62
PRPF8Q6P2Q9 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 57.68□□□□□ -1.188e-11■■■■■ 62
PRPF8Q6P2Q9 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 4-0.15□□□□□ -2.438e-11■■■■■ 62
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PRPF8Q6P2Q9 AP5M1-205ENST00000554931 1691 ntTSL 1 (best)8.39□□□□□ -1.071e-16■■■■■ 62
PRPF8Q6P2Q9 MED21-203ENST00000536711 578 ntTSL 46.99□□□□□ -1.291e-16■■■■■ 62
PRPF8Q6P2Q9 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.421e-16■■■■■ 62
PRPF8Q6P2Q9 USP34-206ENST00000460004 572 ntTSL 45.92□□□□□ -1.461e-16■■■■■ 62
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PRPF8Q6P2Q9 C5orf42-214ENST00000514429 7416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.32□□□□□ -1.561e-16■■■■■ 62
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