Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF43Q68DV7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF43Q68DV7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF43Q68DV7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF43Q68DV7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms