Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC7Q5VTL7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC7Q5VTL7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC7Q5VTL7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms