Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RPRD2Q5VT52 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RPRD2Q5VT52 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
RPRD2Q5VT52 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RPRD2Q5VT52 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
RPRD2Q5VT52 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RPRD2Q5VT52 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RPRD2Q5VT52 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
RPRD2Q5VT52 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RPRD2Q5VT52 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RPRD2Q5VT52 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RPRD2Q5VT52 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RPRD2Q5VT52 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RPRD2Q5VT52 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RPRD2Q5VT52 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
RPRD2Q5VT52 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RPRD2Q5VT52 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RPRD2Q5VT52 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RPRD2Q5VT52 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
RPRD2Q5VT52 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RPRD2Q5VT52 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RPRD2Q5VT52 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RPRD2Q5VT52 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms